Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims1Q99NE5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms