Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms