Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac9Q99N13 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms