Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkd1Q99MH6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms