Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp4Q99ME9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms