Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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