Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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PtprtQ99M80 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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PtprtQ99M80 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprtQ99M80 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
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