Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms