Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms