Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms