Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms