Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmp1Q99KU0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 389.1 ms