Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clint1Q99KN9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms