Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms