Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlgn1Q99K10 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms