Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tlcd1Q99JT6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlcd1Q99JT6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms