Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms