Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms