Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms