Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Ctu1Q99J10 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms