Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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