Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss28Q924N9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms