Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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