Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sf3b5Q923D4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sf3b5Q923D4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sf3b5Q923D4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sf3b5Q923D4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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