Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim59Q922Y2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms