Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms