Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Afg3l1Q920A7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Afg3l1Q920A7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Afg3l1Q920A7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Afg3l1Q920A7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms