Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Pde6cQ91ZQ1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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