Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms