Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms