Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc42ep1Q91W92 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep1Q91W92 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep1Q91W92 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep1Q91W92 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms