Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms