Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms