Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NifkQ91VE6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms