Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms