Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApofQ91V80 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms