Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsx1Q91V10 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsx1Q91V10 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsx1Q91V10 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsx1Q91V10 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsx1Q91V10 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsx1Q91V10 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsx1Q91V10 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsx1Q91V10 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsx1Q91V10 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsx1Q91V10 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsx1Q91V10 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsx1Q91V10 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsx1Q91V10 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsx1Q91V10 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsx1Q91V10 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsx1Q91V10 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsx1Q91V10 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms