Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms