Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms