Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD75

Hip1, Huntingtin-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1Q8VD75 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hip1Q8VD75 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms