Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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