Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Rdh10Q8VCH7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rdh10Q8VCH7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rdh10Q8VCH7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rdh10Q8VCH7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rdh10Q8VCH7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rdh10Q8VCH7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rdh10Q8VCH7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rdh10Q8VCH7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rdh10Q8VCH7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rdh10Q8VCH7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rdh10Q8VCH7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rdh10Q8VCH7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rdh10Q8VCH7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh10Q8VCH7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms