Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef3Q8VCC8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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