Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a8Q8R4D1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a8Q8R4D1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms