Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim29Q8R2Q0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim29Q8R2Q0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim29Q8R2Q0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim29Q8R2Q0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim29Q8R2Q0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim29Q8R2Q0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim29Q8R2Q0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms