Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms