Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms