Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT4

Crb3, Protein crumbs homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb3Q8QZT4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crb3Q8QZT4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crb3Q8QZT4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms