Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5C0

Grhl2, Grainyhead-like protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl2Q8K5C0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl2Q8K5C0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl2Q8K5C0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms