Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ncapd2Q8K2Z4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ncapd2Q8K2Z4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ncapd2Q8K2Z4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ncapd2Q8K2Z4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ncapd2Q8K2Z4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ncapd2Q8K2Z4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd2Q8K2Z4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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